Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 FCRL6-201ENST00000321935 1997 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ORC6-201ENST00000219097 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
DUX4L9Q6RFH8 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms