Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 DNAAF5-202ENST00000403952 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AGAP9-201ENST00000452145 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CCDC174Q6PII3 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 199.8 ms