Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 DRD2-201ENST00000346454 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SYNM-203ENST00000560674 5908 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FAM131B-203ENST00000409408 5856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SNHG14-212ENST00000549804 7844 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MAN2B2-201ENST00000285599 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TASP1-201ENST00000337743 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SAMD4B-201ENST00000314471 4519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
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RRN3P1Q2M238 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 RAPH1-213ENST00000630330 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 LIN54-201ENST00000340417 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AKAP13-202ENST00000394510 9128 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FN1-202ENST00000336916 8435 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 AL357673.2-201ENST00000623663 4969 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ARAP3-203ENST00000508305 4927 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 KCNA1-201ENST00000382545 7997 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.79□□□□□ -0.68
RRN3P1Q2M238 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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