Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TBKBP1-201ENST00000361722 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TRPV6-201ENST00000359396 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 BTRC-203ENST00000393441 6084 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KBTBD7-201ENST00000379483 4734 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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