Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ZCCHC7-201ENST00000322831 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MIR1226-201ENST00000408658 75 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC090696.1-201ENST00000419100 418 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ALDOAP1-201ENST00000491506 1078 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 KRT18P42-201ENST00000505048 1255 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC008750.2-201ENST00000526996 627 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 BCL2L2-PABPN1-201ENST00000553781 1241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PGAP2-204ENST00000396991 1798 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 EEF1G-201ENST00000329251 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TXLNGY-202ENST00000407724 1000 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 GRP-202ENST00000420468 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CA5BP1-205ENST00000435806 1064 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC106789.1-201ENST00000512927 570 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 GRAPL-204ENST00000577213 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 AC245140.2-201ENST00000624054 1939 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GAPVD1Q14C86 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC034205.3-201ENST00000603595 1376 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CTRL-205ENST00000574481 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CREB5-202ENST00000396298 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ARRDC5-201ENST00000381781 1638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 RPL35P1-201ENST00000450819 370 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC006504.5-210ENST00000585827 539 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 CADM1-221ENST00000612235 1042 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 TMEM230-211ENST00000615008 594 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC079331.1-201ENST00000623200 1200 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 AC040160.2-201ENST00000623816 1675 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GAPVD1Q14C86 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms