Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CYP4B1-201ENST00000271153 2171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CBLB-204ENST00000405772 3237 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 OLFML2A-203ENST00000373580 6425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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CUL3Q13618 ARAF-203ENST00000377045 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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CUL3Q13618 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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CUL3Q13618 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
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CUL3Q13618 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
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CUL3Q13618 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 ANKH-201ENST00000284268 8203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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CUL3Q13618 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 NLGN3-206ENST00000612180 3319 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 FUT8-203ENST00000360689 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 RAB37-205ENST00000392614 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
CUL3Q13618 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
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