Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 CWC22-202ENST00000410053 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 CHID1-205ENST00000454838 3255 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SPATA3-AS1-201ENST00000414876 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 LRTM2-202ENST00000535041 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 LINC00664-203ENST00000599078 3760 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 EPHB6-211ENST00000619012 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AP2A1-201ENST00000354293 3388 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 DMTF1-201ENST00000331242 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 GALNT16-201ENST00000337827 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SNX12-207ENST00000622277 2422 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 KIZ-208ENST00000616848 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AC098934.1-201ENST00000443294 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ZNF189-203ENST00000374861 3134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 FP565324.1-201ENST00000636427 3659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 LINC01134-202ENST00000439488 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 HKR1-204ENST00000544914 2854 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ZMYM5-201ENST00000337963 3268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ARAP1-202ENST00000359373 5767 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 PRDM10-204ENST00000423662 5998 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 BISPR-204ENST00000634675 1806 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 RBL1-202ENST00000373664 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 C1orf198-203ENST00000470540 3819 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ST5-230ENST00000530438 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 LINC00540-203ENST00000631321 2412 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 CDK5RAP3-202ENST00000536708 1975 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 PIGC-202ENST00000367728 2630 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ARHGAP6-201ENST00000303025 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 PPP6C-203ENST00000451402 4349 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SLCO2B1-204ENST00000454962 3219 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 HHIPL2-201ENST00000343410 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 DUSP16-201ENST00000228862 3402 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 WDR70-201ENST00000265107 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC12.18□□□□□ -0.46
CD300CQ08708 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms