Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AP002856.2-201ENST00000416553 584 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC011921.1-201ENST00000559739 557 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 PEBP1P2-201ENST00000603980 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC006483.2-201ENST00000609813 515 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 MTUS1-229ENST00000634613 1193 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC008026.2-201ENST00000495438 348 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AL513315.1-201ENST00000640756 1370 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 ZNF100-201ENST00000305570 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 FAM3B-201ENST00000357985 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 CCL24-202ENST00000416943 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CACNB3P54284 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms