Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 ADAM19-203ENST00000517905 3312 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 DLGAP1-202ENST00000400145 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 PTK7-205ENST00000352931 4023 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TAOK2-204ENST00000543033 4072 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 DCAF8L2-203ENST00000545306 2013 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
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PGGT1BP53609 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 ITGB2-205ENST00000397850 3178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 LINC00638-201ENST00000555578 2518 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PGGT1BP53609 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
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