Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLCP48506 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLCP48506 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLCP48506 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 BID-209ENST00000551952 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AC012174.1-201ENST00000562349 714 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GCLCP48506 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 FAM27E5-201ENST00000426869 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 TRPC7-AS1-201ENST00000514459 460 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCLCP48506 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms