Protein–RNA interactions for Protein: P37268

FDFT1, Squalene synthase, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDFT1P37268 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 MARK2P9-201ENST00000430958 1727 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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FDFT1P37268 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FDFT1P37268 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FDFT1P37268 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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