Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SFNP31947 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 BCL2L11-202ENST00000337565 720 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC026310.2-201ENST00000546353 728 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SFNP31947 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SFNP31947 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms