Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 OR4C14P-201ENST00000440929 923 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AF186996.6-201ENST00000485294 149 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SLC13A2-205ENST00000545060 1276 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 NKAPP1-204ENST00000555168 557 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RBPMSLP-201ENST00000433427 502 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 DMKN-211ENST00000436012 848 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RN7SL363P-201ENST00000482412 273 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AL139316.1-201ENST00000555643 568 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC009065.4-201ENST00000563734 543 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LINC01836-201ENST00000586061 829 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC022001.3-201ENST00000606330 596 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SFTPA2-205ENST00000640627 195 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 XAGE2-201ENST00000286049 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 OR7E155P-201ENST00000412208 1014 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 RPSAP69-201ENST00000445739 546 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 TCL1A-209ENST00000557043 980 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
POLD1P28340 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms