Protein–RNA interactions for Protein: P13501

CCL5, C-C motif chemokine 5, humanhuman

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL5P13501 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 ARR3-201ENST00000307959 1292 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 CRIP1P2-201ENST00000425396 228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 RBM14-205ENST00000443702 732 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 NAT9-204ENST00000578822 839 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 AP006248.1-201ENST00000610471 67 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 RDM1-216ENST00000613308 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 KDF1-202ENST00000616918 1651 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CCL5P13501 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL5P13501 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL5P13501 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CCL5P13501 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ZWINT-202ENST00000361148 807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC090907.2-201ENST00000559857 720 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MT1X-202ENST00000562939 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC026461.1-201ENST00000567563 551 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC091691.1-201ENST00000583587 1018 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ZNF677-210ENST00000601413 706 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AL035427.1-201ENST00000602441 387 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CCL5P13501 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 OXGR1-204ENST00000543457 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CCL5P13501 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms