Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ACSS3-203ENST00000548058 9254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CCNC-210ENST00000520429 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC9.26□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GRSF1-201ENST00000254799 6666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CA14-201ENST00000369111 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 WDR92-201ENST00000295121 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CDH11-201ENST00000268603 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CDK5RAP1-202ENST00000346416 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 WNT5A-202ENST00000474267 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 TNRC6C-207ENST00000588847 8527 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
VPREB1P12018 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms