Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL008638.4-201ENST00000624792 1315 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 BX248123.1-201ENST00000429070 606 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CDK2-203ENST00000440311 1031 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LINC00892-203ENST00000454385 686 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 Metazoa_SRP.75-201ENST00000614439 293 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC233280.19-201ENST00000633223 136 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MAD2L1BP-202ENST00000451025 1517 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RPL10-202ENST00000369817 1284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PRSS3P1-201ENST00000503996 742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC100858.1-201ENST00000514059 1228 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC073578.2-201ENST00000618927 464 ntTSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms