Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AP3M2-202ENST00000396926 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 FAM122C-203ENST00000414371 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ARAP1-201ENST00000334211 4942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ASAP1-201ENST00000357668 6344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ABCC10-204ENST00000372530 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PDE2A-203ENST00000418754 2855 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 MAPRE2-201ENST00000300249 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PLXNB1-201ENST00000296440 7143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
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SCN2BO60939 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SCN2BO60939 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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