Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC104961.1-201ENST00000427605 771 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AL365500.1-201ENST00000442783 868 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AL359853.1-202ENST00000415218 544 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC092810.2-201ENST00000431570 362 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MDM1-205ENST00000430606 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CLDN25-201ENST00000453129 754 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ERVV-2B6SEH9 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ERVV-2B6SEH9 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms