Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ARFIP1-203ENST00000405727 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CACNA2D4-220ENST00000585732 2566 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC090617.4-201ENST00000572404 422 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 RHOC-207ENST00000369638 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ERVV-1B6SEH8 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms