Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 SNCB-203ENST00000506696 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
IGSF9Q9P2J2 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGSF9Q9P2J2 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
IGSF9Q9P2J2 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
IGSF9Q9P2J2 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
IGSF9Q9P2J2 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms