Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
USP35Q9P2H5 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
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USP35Q9P2H5 AC124068.2-201ENST00000569473 1109 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
USP35Q9P2H5 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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