Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1D8

PRO2289, Putative uncharacterized protein PRO2289, humanhuman

Predictions only

Length 64 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRO2289Q9P1D8 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 NRP1-208ENST00000395995 5826 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 UBA52-202ENST00000442744 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 ZKSCAN3-203ENST00000377255 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC099489.1-203ENST00000598234 10568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 DNAJB12-201ENST00000338820 4360 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SHPRH-211ENST00000629427 7338 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PRO2289Q9P1D8 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms