Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 PPCDC-201ENST00000342932 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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C9orf16Q9BUW7 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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