Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AC002407.1-201ENST00000636668 3863 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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ZNF439Q8NDP4 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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ZNF439Q8NDP4 ADNP-203ENST00000396029 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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ZNF439Q8NDP4 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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ZNF439Q8NDP4 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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ZNF439Q8NDP4 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 SRPX-205ENST00000538295 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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ZNF439Q8NDP4 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
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ZNF439Q8NDP4 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
ZNF439Q8NDP4 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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