Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZDHHC6-202ENST00000369405 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SH3PXD2B-201ENST00000311601 7777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SACM1L-201ENST00000389061 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 DMPK-219ENST00000600757 3357 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PDK2-203ENST00000503176 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TDRD12Q587J7 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms