Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CPT1A-202ENST00000376618 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CYP26B1-201ENST00000001146 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 FBLIM1-203ENST00000375771 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 APAF1-202ENST00000357310 7055 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SMARCA2-204ENST00000357248 5855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PRKAR1A-203ENST00000392711 4327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PDCD1Q15116 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ZC3H18-201ENST00000301011 3729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ZNF674-AS1-201ENST00000421685 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 POMT1-201ENST00000341012 2912 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CRY2-202ENST00000443527 4203 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 CICP8-201ENST00000455800 2813 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PDCD1Q15116 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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