Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC005993.1-201ENST00000555581 397 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AL162731.1-201ENST00000613248 876 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AIFM1-203ENST00000346424 1200 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MARK2P17-201ENST00000498560 841 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC093700.1-201ENST00000503348 717 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CHIC2-204ENST00000512964 711 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC103736.1-201ENST00000524410 605 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC087442.1-201ENST00000525563 249 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 GPN3-203ENST00000543199 1604 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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PTCH1Q13635 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
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PTCH1Q13635 AC092910.2-201ENST00000491262 348 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC090282.1-201ENST00000572821 534 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CCND3P2-201ENST00000579393 537 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
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PTCH1Q13635 PSMC5-201ENST00000310144 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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PTCH1Q13635 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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PTCH1Q13635 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 CCL25-202ENST00000315626 450 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC068631.1-228ENST00000354642 742 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 NCR1-204ENST00000357397 594 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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PTCH1Q13635 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AP000533.1-201ENST00000456143 1177 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 IGKV1OR-2-201ENST00000457995 350 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC008494.1-201ENST00000497612 796 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC099328.1-201ENST00000498809 1030 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC010478.1-203ENST00000558403 532 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 SRRM2-AS1-204ENST00000573802 818 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
PTCH1Q13635 AC005786.2-201ENST00000592368 369 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
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