Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 DNM3-208ENST00000627582 7625 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ADM2-202ENST00000395738 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CNTNAP5-202ENST00000431078 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 DENND4C-205ENST00000434457 6718 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 LDLRAD4-201ENST00000359446 8486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PHYHIP-201ENST00000321613 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ZNF792-201ENST00000404801 3888 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 LRPAP1-202ENST00000500728 7819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 RIPOR3-202ENST00000327979 4377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 YWHAEP7-202ENST00000620903 2455 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TMEM131L-203ENST00000409959 5017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 NR4A1-202ENST00000360284 2589 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 AL359075.1-201ENST00000476232 2921 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TMBIM6-227ENST00000552699 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 ZFP36L2-201ENST00000282388 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PSMD12-201ENST00000356126 4406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
FOXD4Q12950 PLA2G3-201ENST00000215885 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 CCDC117-201ENST00000249064 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 EBF3-201ENST00000355311 2993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
FOXD4Q12950 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms