Protein–RNA interactions for Protein: P63121

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pro protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63121 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CCDC92-208ENST00000545135 4883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ZNF318-201ENST00000361428 8006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PCDHB9-201ENST00000316105 4415 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PML-210ENST00000563500 4502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 OPLAH-204ENST00000618853 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC005695.1-201ENST00000574307 5672 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 EPN2-202ENST00000347697 4664 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 IST1-203ENST00000378799 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TRPM5-203ENST00000533060 3562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 SCN1B-202ENST00000415950 4537 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ITGAX-201ENST00000268296 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AC012349.1-201ENST00000518662 2643 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 BIRC5-201ENST00000301633 2711 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 ARHGEF33-201ENST00000398800 4300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 AL353608.3-202ENST00000429953 4384 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
HERVK_113P63121 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 CACNA1F-202ENST00000376251 5813 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 EXOC8-201ENST00000366645 5100 ntAPPRIS P1 BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 GATAD2A-201ENST00000358713 5510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SRGAP3-202ENST00000383836 8656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
HERVK_113P63121 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms