Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLCP48506 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLCP48506 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GCLCP48506 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 ANG-202ENST00000397990 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 SKA1-202ENST00000398452 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 RNF216P1-212ENST00000493407 659 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AL078590.3-205ENST00000606039 465 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 NCF4-202ENST00000397147 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 KRT8P43-201ENST00000406052 1458 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GCLCP48506 TBC1D27-202ENST00000424239 1573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 ZNF576-205ENST00000529930 830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 ORMDL2-205ENST00000552672 760 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GCLCP48506 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GCLCP48506 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms