Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 FOXM1-210ENST00000627656 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 DYRK4-201ENST00000010132 1840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TXNDC17-201ENST00000250101 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 NPAS4-201ENST00000311034 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 MYRIP-204ENST00000444716 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 GHITM-201ENST00000372134 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ROPN1B-202ENST00000504401 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 MALL-201ENST00000272462 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ZWILCH-203ENST00000535141 2206 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ACADM-201ENST00000370834 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CSNK1E-201ENST00000359867 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 SLC16A1-201ENST00000369626 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 APOL5-201ENST00000249044 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ADAM8-201ENST00000415217 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ZDHHC11-201ENST00000283441 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CAMKV-209ENST00000477224 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 RPS15A-213ENST00000576436 2190 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
DDIT3P35638 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149.9 ms