Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 RGS9-201ENST00000262406 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 MINDY1-207ENST00000622754 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 NFE2L1-218ENST00000583378 2051 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ATP13A1-202ENST00000357324 3861 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 LINC00863-201ENST00000439559 3287 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 INMT-201ENST00000013222 2559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CHRNA3P32297 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms