Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 OS9-201ENST00000257966 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 UNC5CL-201ENST00000244565 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 EOGT-202ENST00000383701 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MCM3P25205 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 SMG9-201ENST00000270066 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 PLOD2-202ENST00000360060 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 C17orf53-203ENST00000585683 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 CCNE2-205ENST00000520509 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 AC026271.4-201ENST00000578214 1833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 AL022313.4-201ENST00000562756 2046 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 AL805961.2-201ENST00000642139 4817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MCM3P25205 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 COX6B2-210ENST00000593184 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 WDR26-201ENST00000414423 6872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 TMEM248-201ENST00000341567 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 BAHCC1-201ENST00000307745 10342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ADAMTSL4-201ENST00000271643 4250 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 CACNA1G-214ENST00000505165 6633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 PAM-207ENST00000455264 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ARHGAP20-201ENST00000260283 6189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MCM3P25205 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms