Protein–RNA interactions for Protein: P20936

RASA1, Ras GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASA1P20936 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PSMD9-207ENST00000541212 2784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RASA1P20936 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RBM4B-201ENST00000310046 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 CSAG1-203ENST00000370291 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 GRPEL2P1-201ENST00000453145 339 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AC237221.1-201ENST00000561575 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
RASA1P20936 TARBP2-202ENST00000394357 1402 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AC108474.1-201ENST00000507776 421 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
RASA1P20936 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.9 ms