Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 VPS25-201ENST00000253794 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 TRBV7-3-201ENST00000390361 397 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ATP5J-202ENST00000400087 826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC092570.1-201ENST00000414446 469 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 DLK1-205ENST00000556051 469 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL645608.7-201ENST00000607769 351 ntTSL 4 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
SFTPCP11686 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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