Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MSNP1-201ENST00000511640 1732 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LIX1L-201ENST00000604000 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 IFT81-201ENST00000242591 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TOMM40L-209ENST00000545897 2807 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 HTR3A-201ENST00000299961 1994 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PPP2R5E-201ENST00000337537 6659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TBC1D3L-201ENST00000612727 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RPA2-203ENST00000373912 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
SMIM1B2RUZ4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 CIPC-201ENST00000361786 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LDLRAD4-203ENST00000399848 8633 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PRPF40B-209ENST00000548825 3307 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 LHFPL2-201ENST00000380345 5043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 PTPRS-204ENST00000587303 6353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
SMIM1B2RUZ4 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms