Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SMYD5-202ENST00000389501 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FRMD3A2A2Y4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 SGO1-AS1-201ENST00000441442 499 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FRMD3A2A2Y4 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms