Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CEP95-212ENST00000581056 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYM3-206ENST00000373988 6021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
HDGFL3Q9Y3E1 C10orf71-201ENST00000374144 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms