Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 COBL-205ENST00000441453 3785 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 EPHB1-201ENST00000398015 4672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TP73-203ENST00000357733 4899 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 BSDC1-203ENST00000419121 1473 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
XCL2Q9UBD3 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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