Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AL451042.2-201ENST00000424774 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC098934.1-203ENST00000442868 1262 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TEX36-AS1-202ENST00000446081 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 APOC1P1-201ENST00000507983 630 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ARHGAP28Q9P2N2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms