Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ABI2-215ENST00000430418 1676 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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CCDC88CQ9P219 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CCDC88CQ9P219 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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