Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CHCHD2P9-201ENST00000461726 456 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ARMCX6-207ENST00000538627 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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SEMA4CQ9C0C4 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SEMA4CQ9C0C4 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SEMA4CQ9C0C4 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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