Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

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Length 751 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ENDOV-206ENST00000518901 2549 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 ARHGEF1-202ENST00000347545 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SEMA3CQ99985 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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SEMA3CQ99985 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SEMA3CQ99985 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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