Protein–RNA interactions for Protein: Q99653

CHP1, Calcineurin B homologous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHP1Q99653 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MKRN5P-201ENST00000445263 1467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SH2D7-202ENST00000409568 2162 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PPP1R8-202ENST00000311772 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 NTN4-203ENST00000538383 1971 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 BRSK1-206ENST00000590333 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PRRT2-201ENST00000300797 3002 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 TRIM4-203ENST00000355947 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CHP1Q99653 ADGRG3-201ENST00000333493 2728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms