Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 PRPF18-202ENST00000378572 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 DMKN-229ENST00000467637 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 FAM60A-207ENST00000542983 738 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 PGPEP1-203ENST00000595066 762 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SYNGAP1Q96PV0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms