Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
SGF29Q96ES7 GPR68-203ENST00000531499 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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SGF29Q96ES7 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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SGF29Q96ES7 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC093520.1-201ENST00000567545 1767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SGF29Q96ES7 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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