Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 THY1-206ENST00000528522 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MYH14-201ENST00000262269 3848 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ELL-201ENST00000262809 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PPP1R3D-201ENST00000370996 3630 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 ALAS1-204ENST00000469224 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SCG3Q8WXD2 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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