Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC99

FNDC8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC8Q8TC99 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 SLC38A7-201ENST00000219320 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 SERPINI1-201ENST00000295777 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 TCN2-202ENST00000405742 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
FNDC8Q8TC99 AGPAT3-202ENST00000327505 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 DFFB-205ENST00000378209 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 AC005394.2-201ENST00000592347 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 NR4A1-201ENST00000243050 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 OCA2-202ENST00000354638 3186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 SGK2-203ENST00000373092 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 AC022497.1-201ENST00000624916 3691 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 AL390066.1-201ENST00000456414 2302 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 TMOD1-202ENST00000375175 2516 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 PNMA5-204ENST00000452693 3113 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 ZNF689-201ENST00000287461 3547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 AMDHD2-202ENST00000302956 3273 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 C19orf12-209ENST00000623113 4242 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 RPGRIP1-202ENST00000400017 3940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 BDH1-201ENST00000358186 3330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
FNDC8Q8TC99 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms