Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND71

GIMAP8, GTPase IMAP family member 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMAP8Q8ND71 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 C1QA-202ENST00000402322 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 MYLK-AS1-202ENST00000470449 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GIMAP8Q8ND71 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 C12orf73-201ENST00000378090 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AC079336.4-201ENST00000584219 408 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AC021683.1-201ENST00000585798 1767 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SLC4A1-206ENST00000631130 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GIMAP8Q8ND71 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.2 ms