Protein–RNA interactions for Protein: Q6UVM3

KCNT2, Potassium channel subfamily T member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT2Q6UVM3 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 ATF4-202ENST00000396680 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC018638.5-201ENST00000450885 754 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNT2Q6UVM3 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms